Lagring og distribusjon av hydrogen har ein del utfordringer. T.d. er hydrogen svært små molekyler som glir rimeleg lett gjennom stål, og i tillegg fører til at stålet blir sprøtt, slik at det sprekk fort. Det er ekstremt eksplosivt, og energitettheta er rimeleg låg- 1/6 av bensin, og 2/13 av diesel per volum. Det, kombinert med lagringsproblem gjer at det ikkje har vore gjennomførbart å ha forbrenningsmotorer som går på hydrogen.

I tillegg skal hydrogen produserast, som krev energi. Korleis skal vi få det til i massiv skala utan utslepp?